持续在世界各地进行修业之旅的小智(松本梨香 配音)、小刚(うえだゆうじ 配音)和小 阿尔夏珠扭头紧盯着梅霜寒,几乎咆哮般道:“你不是说亲手掩埋了他么?埋在哪里了?”意识到蒙烈极有可能没死亡,梅霜寒一时间也失去了冷静,脸上显现出惊喜与紧张交错的复杂神情来,道:“的确是我亲手掩埋的他,师傅,是不如…”光(豊口めぐみ 配音),历经长途跋涉终于来到了位于山谷丘陵处的目的地阿拉莫斯镇。小镇上耸立着象征时间与空间的时光之塔,新一轮的神奇宝贝竞赛将在塔的下方举行。小智一行走错了路,却由此结识当地的美丽女孩艾丽丝(加藤ローサ 配音)。紧张的战斗与快乐的游玩,却未察觉危险正悄悄逼进。小智遭到噩梦精灵达库莱伊的袭击,虽然达库莱伊被当地所有人讨厌,但是它似乎想将某种危险、恐怖的信息及时传给小智一行,关于时空之塔的秘密即将揭开……